Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifi35Q9D8C4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifi35Q9D8C4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms