Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Arpc5lQ9D898 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arpc5lQ9D898 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms