Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PudpQ9D5U5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PudpQ9D5U5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms