Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms