Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc83Q9D4V3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms