Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al3Q9D4U4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al3Q9D4U4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms