Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Odf2lQ9D478 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf2lQ9D478 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms