Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933436I01RikQ9D3T1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933436I01RikQ9D3T1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms