Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms