Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fcf1Q9CTH6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fcf1Q9CTH6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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