Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpbpbQ9CQC0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TpbpbQ9CQC0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms