Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
StambpQ9CQ26 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
StambpQ9CQ26 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms