Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp3Q9CQ10 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chmp3Q9CQ10 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp3Q9CQ10 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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