Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Commd4Q9CQ02 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms