Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2a1Q99PM3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2a1Q99PM3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms