Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl3Q99N95 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl3Q99N95 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl3Q99N95 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Mrpl3Q99N95 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mrpl3Q99N95 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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