Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nmd3Q99L48 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms