Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hps4Q99KG7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hps4Q99KG7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms