Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp11Q99K46 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms