Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp2Q99K23 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms