Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf11Q99JX1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf11Q99JX1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms