Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atad3Q925I1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atad3Q925I1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms