Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhdc4Q921I2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc4Q921I2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms