Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sh3bgrl3Q91VW3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms