Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms