Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccm2lQ8VCC6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2lQ8VCC6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms