Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc12Q8K5B8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms