Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufs8Q8K3J1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufs8Q8K3J1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms