Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SbsnQ8CIT9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SbsnQ8CIT9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms