Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms