Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm28Q8CGC6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbm28Q8CGC6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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