Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdc34Q8CFI2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdc34Q8CFI2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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