Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc17Q8CE13 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc17Q8CE13 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms