Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc87Q8CDL9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc87Q8CDL9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms