Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra5Q8BHJ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra5Q8BHJ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms