Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sv2bQ8BG39 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms