Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZW0

Stk35, Serine/threonine-protein kinase 35, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk35Q80ZW0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk35Q80ZW0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk35Q80ZW0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms