Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pja2Q80U04 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms