Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1bQ7TSF1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1bQ7TSF1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms