Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsf18Q7TS55 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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