Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Actn1Q7TPR4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms