Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prrc2bQ7TPM1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrc2bQ7TPM1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms