Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap1s3Q7TN05 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap1s3Q7TN05 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms