Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17leQ7M764 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17leQ7M764 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms