Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab35Q6PHN9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab35Q6PHN9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms