Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scaf4Q6PFF0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms