Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atl2Q6PA06 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atl2Q6PA06 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms