Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PcnpQ6P8I4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PcnpQ6P8I4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms