Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc148Q6P5U8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc148Q6P5U8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc148Q6P5U8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc148Q6P5U8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc148Q6P5U8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc148Q6P5U8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc148Q6P5U8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc148Q6P5U8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc148Q6P5U8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc148Q6P5U8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc148Q6P5U8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc148Q6P5U8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc148Q6P5U8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc148Q6P5U8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc148Q6P5U8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms