Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Krt77Q6IFZ6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Krt77Q6IFZ6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Krt77Q6IFZ6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt77Q6IFZ6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms